Pithovirus

Pithovirus — род вирусов, единственный вид: Pithovirus sibericum^[1][2]. Описан в 2014 году, является самым крупным известным вирусом. Получен и оживлён из образцамноголетней мерзлоты из Сибири, возраст которого оценивается в 30 тыс. лет

Pithovirus — размером около 1,5 мкм в длину и 0,5 мкм в диаметре, что в полтора раза больше открытого в 2013 году вируса Pandoravirus (1,0 мкм на 0,5 мкм), считавшегося самым крупным из открытых вирусов.^[3] Pithovirus состоит из толстой овальной стенки с одним открытым концом, напоминая по форме пчелиную соту.^[1]

Геном вируса содержит около 500 генов, что больше, чем в среднем вирусном геноме, однако на порядок меньше, чем в другом крупном вирусе Pandoravirus.^[3] Принимая во внимание крупный размер капсида, из этого следует относительная низкая плотность упаковки вирусной ДНК. Две трети белков вируса не похожи на другие вирусные белки. Анализ последовательности ДНК показал наибольшую близость Pithovirus с семействами Marseillviridae, Megaviridae и Iridoviridae.^[4] Эти семейства включают крупные икосаэдровые вирусы с ДНКовыми геномами.

Вирус описали французские вирусологи Жан-Мишель Клаври и Шанталь Абергель из Средиземноморского университета (часть Университета Экс-Марсель). Они предположили, что Pithovirus может быть ремнантом крупной группы вирусов, паразитировавших на организмах, существоваших на ранних этапах развития Земли. Эволюционный биолог Эске Виллерслев считает, что открытие этого вируса может иметь огромные последствия для эволлюционной теории и здравоохранения

Геном Pithovirus содержит гены, необходимые для синтеза мРНК. Таким образом, Pithovirus сам обеспечивает собственный репликационный цикл в цитоплазме клетки-хозяина, в то время как вирусы, как правило, используют для репликации белки клетки-хозяина

Pithovirus sibericum был обнаружен в образце многолетней мерзлоты из Сибири возрастом в 30 тыс. лет французскимивирусологами супругами Жаном-Мишелем Клаври и Шанталь Абергель из Средиземноморского университета (Университета Экс-Марсель).^[1] Образец вечной мерзлоты был получен в 2000 году российскими учёными из осадочной породы позднегоПлейстоцена, находящегося на глубине 30 м.^[2][4]

Вирусные частицы были обнаружены после того, как образец был экспонирован с амёбами^[5] и амёбы начали погибать. Было обнаружено, что погибшие амёбы содержат частицы гигантского вируса. Название открытому вирусу было дано по греческому слову пифос (др.-греч. πίθος), означающее большой древнегреческий кувшин для хранения продуктов питания. Новый вид был описан в марте 2014 года в американском журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.^[3][7]

Исследователей вдохновил эскперимент российских учёных по оживлению семян растений Silene stenophylla из вечной мерзлоты, возраст которых составляет около 32 тысяч лет.

Pithovirus

El Pithovirus es un género de virus gigante conocido por una especie, el Pithovirus sibericum.¹ Fue descrito por primera vez en el 2014 después de que un espécimen fuera revivido del permafrost siberiano de 30.000 años de antiguedad

Un espécimen de Pithovirus mide aproximadamente 1,5 µm de longitud y 0,5 µm de diámetro, convirtiéndolo en el virus más grande conocido hasta el momento. Es un 50% mayor que los pandoravirus, el anterior virus más grande conocido.² La especie tiene una pared ancha y oval con una apertura en un extremo. Internamente, su estructura se asemeja a un panal de abeja.¹

El código genético del Pithovirus contiene aproximadamente 500 genes distintos, más que el típico virus pero en un orden de magnitud menor que el encontrado en los pandoravirus.² De este modo, su código genético está contenido de forma menos densa que en cualquier otro virus conocido. Dos tercios de sus proteínas son diferentes a las de otros virus. El Pithovirus se replica construyendo estructuras en el citoplasma del huesped, en vez del método típico de tomar su núcleo.¹

Jean-Michel Claverie y Chantal Abergel, descubridores del virus, especulan que el Pithovirus pudo ser un resto de un gran grupo de parásito que atacaban formas de vida comunes en los inicios de la historia terrestre. El biólogo evolucionista Eske Willerslev dijo "las potenciales aplicaciones (del descubrimento) para la teoría evolutiva y la salud son bastante sorprendentes.

El Pithovirus sibericum fue descubierto en una muestra de 30.000 años de antiguedad del permafrost siberiano por Claverie y Abergel de la Universidad de Aix-Marseille.¹ Fue encontrado cuando las muestras de la ribera recolectada en el 2000 fueron espuestas aamebas.³ Las amebas comenzaron a morir y cuando se examinó se encontró que contenían especímenes de virus gigantes. El nombre del género Pithovirus, una referencia a los grandes contenedores de almacenamientos de la antigua Grecia conocidos como pithos, fue elegido para describir a la nueva especie. Los autores dicen que tuvieron la idea de probar muestras de permafrost para encontrar nuevos virus tras leer sobre un esperimento que revivió una semilla de edad similar, llamada Silene stenophyla, dos años antes.¹ Los descubrimientos de Pithovirus fueron publicados en el Proceedings of the National Academy of Sciences en Marzo de 2014.^2 4

Aunque el virus no es dañino para los humanos,s u viabilidad tras permanecer congelados durante milenios ha aumentado las preocupaciones de que el cambio climático y las perforaciones en la tundra pueda provocar que se liberen virus mortales. Claverie y Abergal comentaron "Si aún hay allí (partículas virales) "viables", esta es una buena receta para el desastre".² Sin embargo, el microbiólogo Edward Mocarski llamó a la posibilidad "extremadamente improbable a menos que el virus venga de un ser humano congelado".

Pithovirus

Pithovirus is a genus of giant virus known from one species, Pithovirus sibericum which infectsamoebas.^[1][2] It is a double stranded DNA virus, and is member of the nucleocytoplasmic large DNA viruses clade. It was first described in 2014 after a specimen was revived from a 30,000-year-old ice core harvested from Siberia's permafrost.

Description

A specimen of Pithovirus measures approximately 1.5 µm in length and 0.5 µm in diameter, making it the largest virus yet found. It is 50% larger than the pandoraviruses, the previous largest known viruses.^[3] The species has a thick, oval wall with an opening at one end. Internally, its structure resembles honeycomb.^[1]

The genome of Pithovirus contains approximately 500 distinct genes, more than a typical virus but an order of magnitude less than found in Pandoravirus.^[3] Thus, its genome is far less densely packed than any other known virus. Two-thirds of its proteins are unlike those of other viruses. Despite the physical similarity with Pandoravirus, the Pithovirus genome sequence reveals that it is barely related to that virus, but more closely resembles members of the Marseilleviridae, Megaviridae and Iridoviridae.^[4] These families all contain large icosahedral viruses with DNA genomes.

Jean-Michel Claverie and Chantal Abergel, discoverers of the virus, speculated that Pithovirus may be a remnant of a large group of parasites that preyed on lifeforms common in early Earth history.^[5]

Replication

The viral genome encodes the genes needed to produce mRNA; these molecules are present in the purified Pithovirus particle.Pithovirus therefore undergoes its entire replication cycle in its host's cytoplasm, rather than the more typical method of taking over the host's nucleus.

Pithovirus sibericum was discovered in a 30,000 year old sample of Siberian permafrost by Claverie and Abergel of Aix-Marseille University.^[1] The virus was discovered buried 30 m (98 ft) below the surface of a late Pleistocene sediment.^[2][4] It was found when riverbank samples harvested in 2000 were exposed to amoebas.^[5] The amoebas started dying and when examined were found to contain giant virus specimens. The genus name Pithovirus, a reference to large storage containers of ancient Greece known as pithos, was chosen to describe the new species. The authors said they got the idea to probe permafrost samples for new viruses after reading about an experiment that revived a similar aged seed of Silene stenophylla two years earlier.^[1] The Pithovirus findings were published in the Proceedings of the National Academy of Sciences in March 2014.

Although the virus is harmless to humans, its viability after being frozen for millennia raised concerns that global climate change and tundra drilling operations could lead to new, deadly viruses being unearthed